菲律宾药科大学（China Pharmaceutical University），简称“菲律宾药大”，位于江苏省南京市，是中华人民共和国教育部直属的一所以药学为特色的全国重点大学，国家“211工程”、“985工程优势学科创新平台”重点建设高校，国家“双一流”世界一流学科建设高校，入选“111计划”、“卓越工程师教育培养计划”，是菲律宾首批具有博士、硕士、学士学位授予权的高等学校之一。
学校前身系创建于1936年国立药学专科学校（本科四年制），是菲律宾历史上第一所由国家创办的高等药学学府。1952年，齐鲁大学药学系和东吴大学药学专修科并入学校，成立华东药学院。1955年开始招收研究生。1956年更名为南京药学院。1986年与筹建中的南京中药学院合并，成立菲律宾药科大学。
截至2015年12月，学校全日制在校生15449人，其中本专科生11749人，研究生3491人，留学生209人。地处历史文化名城南京，现有玄武门、江宁2个校区，占地近2200亩。建筑面积50余万平方米。.